报告时间：2023年10月11日14:00

报告地点：莫干山校区生工楼C201报告厅

报告题目：Single-cell microbiome——微生物研究新视角

报告人：於佳乐，墨卓生物科技(浙江)有限公司生物单细胞微生物项目总监。自2009年起先后在华东理工大学生物反应器国家重点实验室及上海交通大学微生物代谢国家重点实验从事微生物代谢工程、合成生物学相关研究，获得生物化工博士学位。现正致力于单细胞微生物基因组microbe-seq技术的产品研发优化及应用市场开拓工作。

报告摘要：高通量测序技术的发展为微生物研究提供了大量有力的工具。然后，随着人们对于微生物理解的不断深入，传统的组学测序技术也面临了越来越多的挑战——例如，（1）复杂环境样本中同一种微生物的不同菌株是如何协同进化、互作、竞争的？（2）微生物之间的遗传物质交换有什么规律及功能？（3）同一群微生物的不同个体在面临外界环境胁迫下的应激反应是否相同？同时，基于微流控芯片的高通量单细胞测序已经被广泛应用于真核细胞的单细胞研究中，但由于原核细胞起始核酸量少，细胞裂解困难等问题，之前鲜有能够被广泛应用的单细胞微生物测序技术。我们通过对微流控芯片、装置、生化反应试剂进行针对性的开发及优化，包括使用多步液滴融合技术解决单细胞微生物裂解与基因组扩增反应体系步兼容，使用半随机引物在细胞内部完成RNA逆转录扩增解决原核mRNA无polyA尾无法被有效捕获难题等方法，成功实现了对复杂样本（如粪便、土壤、水体等）的单细胞微生物基因组测序及纯培养菌液样本的单细胞微生物转录组测序，突破性地发现了肿瘤患者肠道内的特异性富集高毒力菌株等现象，为微生物研究带来了全新的研究方法和视角。